Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX2P32243 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX2P32243 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX2P32243 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms