Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms