Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SSFA2P28290 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSFA2P28290 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms