Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB11O95342 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms