Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX3O95076 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX3O95076 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX3O95076 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX3O95076 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX3O95076 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX3O95076 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALX3O95076 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX3O95076 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX3O95076 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms