Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2AO43633 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms