Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP3O14828 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP3O14828 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP3O14828 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms