Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARVCFO00192 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms