Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms