Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C5Q9Y5Q8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C5Q9Y5Q8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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