Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms