Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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