Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALD1Q9ULE6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms