Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms