Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms