Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms