Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2OQ9C0C9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms