Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms