Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRACR2AQ9BSW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms