Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms