Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD1Q99460 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms