Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms