Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms