Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4CQ96DT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms