Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1Q8TAE8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms