Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms