Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZBED9Q6R2W3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms