Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LARP1BQ659C4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms