Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RSPH4AQ5TD94 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms