Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms