Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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