Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRY1Q16526 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CRY1Q16526 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CRY1Q16526 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRY1Q16526 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRY1Q16526 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRY1Q16526 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRY1Q16526 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRY1Q16526 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRY1Q16526 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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