Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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