Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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