Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 OSW7YFR039C 1533 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 SMI1YGR229C 1518 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 PBS2YJL128C 2007 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YKU70YMR284W 1809 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 EBS1YDR206W 2655 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 OAF3YKR064W 2592 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 HTL1YCR020W-B 237 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RPS29BYDL061C 171 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 ADK1YDR226W 669 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RPS26BYER131W 360 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 FMP10YER182W 735 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YIL165CYIL165C 360 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YJL150WYJL150W 303 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 MRP8YKL142W 660 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RPL37AYLR185W 267 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RPL26AYLR344W 384 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 SSO1YPL232W 873 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YPK9YOR291W 4419 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 NAM2YLR382C 2685 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RAD61YDR014W 1944 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RPL35AYDL191W 363 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 SPC19YDR201W 498 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 RPL29YFR032C-A 180 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 BCD1YHR040W 1101 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 OPT2YPR194C 2634 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 BBC1YJL020C 3474 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 PRK1YIL095W 2433 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 HFA1YMR207C 6372 nt3.9□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 TEL1YBL088C 8364 nt3.9□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YER088C-AYER088C-A 324 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YJL135WYJL135W 318 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 ATG33YLR356W 594 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SPP382YLR424W 2127 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SUI1YNL244C 327 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 RPB11YOL005C 363 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 EGD1YPL037C 474 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 MGR1YCL044C 1254 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 IZH3YLR023C 1632 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SEN1YLR430W 6696 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 snR55snR55 98 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 RPS13YDR064W 456 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 HTA1YDR225W 399 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 ECM34YHL043W 513 nt3.89□□□□□ -1.79
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TY1A-NL1Q12391 YOR050CYOR050C 348 nt3.89□□□□□ -1.79
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TY1A-NL1Q12391 SSP1YHR184W 1716 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 MVP1YMR004W 1536 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 NPR2YEL062W 1848 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YLL032CYLL032C 2478 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 PRP39YML046W 1890 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YJR023CYJR023C 402 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 RAD27YKL113C 1149 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 HEM4YOR278W 828 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 LTP1YPR073C 486 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SRP68YPL243W 1800 nt3.88□□□□□ -1.79
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TY1A-NL1Q12391 STE14YDR410C 720 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YPL142CYPL142C 318 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YBR137WYBR137W 540 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 RSC3YDR303C 2658 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 BRE4YDL231C 3378 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YGL052WYGL052W 306 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YGR164WYGR164W 336 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 HSK3YKL138C-A 210 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 JHD2YJR119C 2187 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SBE2YDR351W 2595 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 PEX5YDR244W 1839 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 MDM32YOR147W 1869 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SSH1YBR283C 1473 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YDR061WYDR061W 1620 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 DPB11YJL090C 2295 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SGO1YOR073W 1773 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YBR197CYBR197C 654 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 VIK1YPL253C 1944 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 SRB4YER022W 2064 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 DNM1YLL001W 2274 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 MIS1YBR084W 2928 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 DBP6YNR038W 1890 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YCF1YDR135C 4548 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 ARF1YDL192W 546 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 RPS0AYGR214W 759 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 TMA22YJR014W 597 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 GTT2YLL060C 702 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 FAS2YPL231W 5664 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1A-NL1Q12391 YDR048CYDR048C 315 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-NL1Q12391 DAD4YDR320C-A 219 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1A-NL1Q12391 YGR269WYGR269W 327 nt3.83□□□□□ -1.8
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