Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms