Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms