Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms