Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CD164Q04900 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD164Q04900 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms