Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 EMC6YLL014W 327 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MRPL44YMR225C 297 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PET123YOR158W 957 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ACM1YPL267W 630 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 AIM4YBR194W 372 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 TRA1YHR099W 11235 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 FUS2YMR232W 2034 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ASI3YNL008C 2031 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 BNI4YNL233W 2679 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 STE11YLR362W 2154 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SGM1YJR134C 2124 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDL187CYDL187C 330 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 EMI1YDR512C 564 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MTC7YEL033W 420 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ERG28YER044C 447 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 FAR7YFR008W 666 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PCL5YHR071W 690 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ILM1YJR118C 612 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 FYV7YLR068W 456 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YLR076CYLR076C 423 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 DYN3YMR299C 939 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YNL203CYNL203C 612 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ATX1YNL259C 222 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 RIX1YHR197W 2292 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 CWH41YGL027C 2502 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 NEL1YHR035W 1893 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.4□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.4□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.4□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MAK5YBR142W 2322 nt2.4□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDR061WYDR061W 1620 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SNA4YDL123W 423 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YFL019CYFL019C 354 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SLX9YGR081C 633 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 MVB12YGR206W 306 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SCEIQ0160 708 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YNL089CYNL089C 477 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 CSI2YOL007C 1026 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YOR055WYOR055W 435 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YBR051WYBR051W 351 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 VPS13YLL040C 9435 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 BRE5YNR051C 1548 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SPF1YEL031W 3648 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 GCD10YNL062C 1437 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 PHR1YOR386W 1698 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 RIM13YMR154C 2184 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 NCS2YNL119W 1482 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 CPR5YDR304C 678 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 MXR1YER042W 555 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 TDA2YER071C 381 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YFR054CYFR054C 579 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 ARC18YLR370C 537 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 ATP18YML081C-A 180 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 ATP3YBR039W 936 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SWR1YDR334W 4545 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 VTC3YPL019C 2508 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YGR045CYGR045C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 RPL11BYGR085C 525 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YJL169WYJL169W 369 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 LSM8YJR022W 330 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 MLH1YMR167W 2310 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 RPL11AYPR102C 525 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 PSD2YGR170W 3417 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 STN1YDR082W 1485 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 UBP1YDL122W 2430 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 PHO91YNR013C 2685 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 IRA2YOL081W 9240 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YCR001WYCR001W 315 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 PRM8YGL053W 714 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YGR228WYGR228W 345 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 ACF4YJR083C 930 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YAL037WYAL037W 804 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SLK19YOR195W 2466 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 AFR1YDR085C 1863 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 MED1YPR070W 1701 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 HFM1YGL251C 3564 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 RGL1YPL066W 1440 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 HMRA1YCR097W 381 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YIL029CYIL029C 429 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 AYR1YIL124W 894 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 PSY1YKL076C 384 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 MRPL38YKL170W 417 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 PAI3YMR174C 207 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 RRT1YBL048W 312 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YNL043CYNL043C 321 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 YNL122CYNL122C 348 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SEC66YBR171W 621 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 TMA64YDR117C 1698 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 SKO1YNL167C 1944 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 UTP15YMR093W 1542 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 HOP1YIL072W 1818 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS1Q03785 TAF2YCR042C 4224 nt2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.5 ms