Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms