Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms