Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms