Protein–RNA interactions for Protein: P34223

SHP1, UBX domain-containing protein 1, yeast

Predictions only

Length 423 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	P34223	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YMR141C	YMR141C	309 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	GAL7	YBR018C	1101 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	TOM70	YNL121C	1854 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YGR242W	YGR242W	309 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	ATP19	YOL077W-A	207 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YOR364W	YOR364W	369 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	EXO84	YBR102C	2262 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YEL1	YBL060W	2064 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YOR343W-A	YOR343W-A	1317 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	GUP1	YGL084C	1683 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	PRM8	YGL053W	714 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	CIC1	YHR052W	1131 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YIR020C	YIR020C	303 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	BER1	YLR412W	825 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	HEM4	YOR278W	828 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	NDT80	YHR124W	1884 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	ALY1	YKR021W	2748 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	MED1	YPR070W	1701 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	PHR1	YOR386W	1698 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	TFB1	YDR311W	1929 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	RRI2	YOL117W	1938 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	EAF6	YJR082C	342 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	NYV1	YLR093C	762 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YLR252W	YLR252W	306 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YPR014C	YPR014C	330 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	VID24	YBR105C	1089 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SPR3	YGR059W	1539 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	DAL5	YJR152W	1632 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YCL019W	YCL019W	5313 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	VHR2	YER064C	1518 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	TFC1	YBR123C	1950 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	MET32	YDR253C	576 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YMR144W	YMR144W	1029 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	BNA4	YBL098W	1383 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SRC1	YML034W	2505 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YCR108C	YCR108C	192 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YDR220C	YDR220C	294 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	AAD16	YFL057C	459 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YHR052W-A	YHR052W-A	195 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YHR054W-A	YHR054W-A	195 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	DAD2	YKR083C	402 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YNL122C	YNL122C	348 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	PHO80	YOL001W	882 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	PET123	YOR158W	957 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	ICR1	ICR1	3199 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SMC2	YFR031C	3513 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	BOI1	YBL085W	2943 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YDL009C	YDL009C	324 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	RPS26B	YER131W	360 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	RSR1	YGR152C	819 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	AIM36	YMR157C	768 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YPR096C	YPR096C	303 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	snR191	snR191	274 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SNU56	YDR240C	1479 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	DBP7	YKR024C	2229 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YLR278C	YLR278C	4026 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	RMT2	YDR465C	1239 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YGL042C	YGL042C	306 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	BAT1	YHR208W	1182 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	AYR1	YIL124W	894 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	SYS1	YJL004C	612 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	YAL037W	YAL037W	804 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	ICY1	YMR195W	384 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.71	□□□□□ -1.97
SHP1	P34223	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SHP1	P34223	DUF1	YOL087C	3351 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SHP1	P34223	INP52	YNL106C	3552 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SHP1	P34223	ERG28	YER044C	447 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SHP1	P34223	AFB1	YLR040C	675 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SHP1	P34223	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SHP1	P34223	MRPL44	YMR225C	297 nt		2.71	□□□□□ -1.98

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