Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRHP20396 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRHP20396 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRHP20396 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRHP20396 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRHP20396 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRHP20396 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TRHP20396 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TRHP20396 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRHP20396 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms