Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms