Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAV1P15498 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAV1P15498 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VAV1P15498 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAV1P15498 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms