Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OFD1O75665 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OFD1O75665 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OFD1O75665 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OFD1O75665 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OFD1O75665 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms