Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA4O75335 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms