Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND1O60716 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms